Jedna z najlepších hier v celej Metal Gear Solid franšíza je z roku 2004 Metal Gear Solid 3: Snake Eater , ktorú napísal a režíroval Hideo Kojima a pôvodne bola vydaná pre PlayStation 2. Hra slúži ako prequel k predchádzajúcim hrám v sérii. Hra sa odohráva v roku 1964 a bývalý Green Beret Naked Snake vyslal na misiu extrémnych čiernych operácií hlboko do sveta. Sovietsky zväz vyťažil zbehnutého vedca pracujúceho na prísne tajnom vojenskom projekte.
V priebehu hry, počiatky Metal Gear programu a antagonistické Veľký šéf a Revolver Ocelot boli odhalené, na čo nadviazali ďalšie tituly. Avšak populárne teória fanúšikov ide o krok ďalej a naznačuje to Snake Eater Udalosti sú vlastne prepracovaným programom virtuálnej reality, ktorý zažil Solid Snake, aby lepšie pochopil Big Boss, zdroj genetického materiálu, ktorý ho klonoval a stal sa z jeho najväčších nepriateľov.
The Metal Gear franšíza nie je cudzia ani pri využívaní obsahu VR, často ako tréningových cvičení na lepšie pochopenie nepriateľov a zdokonaľovanie taktických špionážnych akčných schopností. Pôvodný 1998 Metal Gear Solid nechal Solid Snake používať misie VR, aby pomohol hráčom trénovať mimo hlavnej hry pod rúškom ako tréningové misie pre Snake. Rozšírená verzia z roku 1999 Metal Gear Solid: Integral zahŕňal stovky VR misií na predstavenie hry v rôznych prostrediach. Metal Gear Solid 2: Sons of Liberty protagonista Raiden podstúpil nespočetné množstvo simulácií VR, aby lepšie pochopil Solid Snake, rovnako ako to predpokladá teória, ktorú robí Snake pred udalosťami v roku 2008 Metal Gear Solid 4: Guns of the Patriots .
Teória poukazuje na indície, ktoré Snake Eater je simulácia hneď od začiatku, pričom Naked Snake si na briefingu misie najskôr pomýlil názov svojej úlohy ako „Virtuálna misia“ namiesto skutočného názvu „Virtuous Mission“, kým ho opravil major Zero. Akonáhle je Naked Snake nasadený vo vnútri Sovietskeho zväzu, stopy sa znova dostanú na povrch, ak hráč urobí chyby pri ukončení hry vrátane vlastnej smrti. Obrazovka „Game Over“, ktorá bliká vždy, keď je Naked Snake zabitý, obsahuje text „Time Paradox“, ktorý naznačuje, že Snake umiera desaťročia predtým, ako splní svoj osud, pretože Big Boss má za následok ukončenie programu a spustenie systému v skoršom období. Podobne zabitie Revolvera Ocelota skôr, ako bude môcť sledovať svoju vlastnú minulosť ako opakujúci sa nemesis hry, vedie k tomu, že Roy Campbell kritizoval hráča za odchýlenie sa od časovej osi.
Samozrejme to všetko mohli byť iba mazané prikývnutia a vtipy, než by sa to malo brať vážne Snake Eater je pokročilá výroba VR pre Solid Snake. Zmätok nahého hada počas briefingu misie na začiatku hry by mohol byť rovnako ľahkým odkazom na misie VR pridané k Integrálne ; pre franšízu, ktorá sa často dobromyseľne pýši zábavou na svojom vlastnom mýte, by to nebolo na mieste. Podobne by text a odchýlky od časovej osi mohli byť v znamení, že Kojima potichu dá hráčom najavo, že sa majú držať príbehu, ktorý sa snaží povedať, a nie navrhnúť ukončenie programu v dôsledku odchýlenia sa od predpísaných hraníc.
Teória, ktorá Snake Eater je iba prepracovaný program VR naznačuje, že celá hra je spravodlivá Assassin's Creed predtým Assassin's Creed , pričom Snake žil v pamäti svojich predchodcov. Príbeh Naked Snake / Big Boss však pokračuje aj v roku 2006 Metal Gear Solid: Portable Ops Roku 2010 Metal Gear Solid: Peace Walker a Metal Gear Solid V: Ground Zeroes / Fantómová bolesť . Existencia týchto následných opatrení však mierne podkopáva teóriu fanúšikov Snake Eater ako samostatná skúsenosť s VR je stále možné. Tak aj tak, Snake Eater zostáva jedným z vrcholov uznávanej franšízy videohier a jej najstarším chronologickým príbehom, ktorý vrhá svetlo na jednu z nuancovanejších a morálne komplexnejších postáv videohier vôbec.