Svet Naruto bol takmer vždy vo vojnách. Pred vytvorením systému dedín shinobi trvala éra bojujúcich štátov celé desaťročia, ak nie storočia a videla jeden klan zabíjať druhý, aby získal moc. S Hashirama Senju a Madara Uchiha vytvorili miesto, kde mal v Konohagakure prosperovať mier , nasledovali ich ďalšie veľké národy, a tak sa zrodili dediny shinobi.
Zrod dedín shinobi však vojny nezastavil. Krátko nato sa svet zaplietol do prvej veľkej vojny s nindžami, po ktorej nasledovali ďalšie tri. Tu je každá veľká ninja vojna v Naruto série rozpísané a vysvetlené.
4Prvá veľká ninja vojna
Prvá veľká ninja vojna sa začala krátko po vytvorení dedín shinobi a bolo na nej vidieť takmer všetky národy. Táto vojna začala prepuknúť späť, keď bol Hashirama Senju prvým hokom v Konohagakure. Hashirama prosil o mier a rozhodol sa rozdeliť Sledované zvieratá v rámci piatich veľkých národov kvôli stabilite, čo sa však nepodarilo.
Boj Madary Uchihy proti Onokimu a Mu ďalej zasial nedôveru medzi dedinami, pretože chcel, aby vládol Konoha. Tobirama Senju prevzal moc nad Hokageom, keď v určitom okamihu zúrili vojny. Kumogakure a Konohagakure boli silne zapojení do vojen proti sebe a v jednom konkrétnom okamihu ich jednotka Kinkaku zabila Tobirama Senju. Hiruzen Sarutobi bol menovaný za tretieho hokaša Konohagakure. Prvá veľká ninja vojna sa nakoniec skončila zmluvou o prímerí a vojny sa na chvíľu zastavili, avšak mier, ktorý vytvorila, bol iba dočasný.
3Druhá veľká ninja vojna
Druhá veľká ninja vojna sa začala nedlho po prvej, vie sa o nej však veľmi málo. Predpokladá sa, že po prvej veľkej ninjskej vojne došlo medzi národmi k obrovským hospodárskym rozdielom, ktoré si vyžiadali veľa životov a zanechali každú dedinu poznačenú. To nakoniec viedlo k druhej veľkej ninja vojne.
Zahŕňalo Konohagakure, Iwagakure, Sunagakure a dokonca aj Amegakure. Tretí Hokage viedol Konohu do tejto vojny a väčšina bitiek sa viedla v Amegakure. Zdá sa, že záver tejto vojny naznačuje, že Konohagakure zvíťazila. Rovnako ako každá iná dedina však utrpeli obrovské straty. Počas tejto vojny bojovali študenti Hiruzena Sarutobiho proti Hanzovi Salamanderovi a dostali meno Legendárny Sannin. Jiraiya vycvičil Ame Orphans a nakoniec Nagato vyhlásil túžbu po úplnom mieri vo svete.
dvaTretia veľká ninja vojna
Tretia veľká nindžská vojna sa odohrala, pretože národné sily národov shinobi postupne upadali a po hraniciach sa ešte dlho odohrávali malé bitky. Nakoniec sa tieto bitky zväčšili, až kým nepohltili celé národy a nezmenili sa na tretiu veľkú ninja vojnu. Táto vojna sa odohrala asi 10 rokov pred začiatkom Naruto série a videli všetky dediny Konohagakure, Kumogakure, Sunagakure, Iwagakure a Kirigakure.
Pretože dediny už boli nestabilné, vojny boli nedostatočné, a preto boli na bojisko vrhané deti, ktoré boli sotva Genin. V dôsledku toho prišlo v tretej veľkej ninjskej vojne o život. Toto je vojna, v ktorej tretí Raikage položil život pri samotných bojoch s 10 000 shinobi a kde si Minato Namikaze urobil veľké meno. Skončilo to Iwagakure a Konohagakureovou zmluvou o prímerí, pretože boli zodpovední hlavne za vojnu. Podľa Naruto anime, Onoki nebol pripravený prijať zmluvu a urobil tak iba preto, že Minato Namikaze bez pomoci sily bez námahy zložil silu 1 000 Iwagakure shinobi. Toto úsilie mu nakoniec vynieslo titul štvrtý Hokage.
1Štvrtá veľká ninja vojna
Štvrtá veľká ninja vojna sa začala v druhej polovici roku Naruto a mužom, ktorý za to bol primárne zodpovedný, bol Obito Uchiha, ktorý vyhľadal pomoc u Kabuta Yakushiho. Na rozdiel od iných vojen neboli národy Shinobi medzi sebou vo vojne a namiesto toho boli zjednotení proti spoločnému nepriateľovi v Akatsuki. Cieľom nepriateľa bolo zhromaždiť Osem a Deväť chvostov, aby sa dokončil projekt Tsuki no Me a vrhla večná ilúzia na každého živého tvora. Vďaka Kabutovi bolo oživených veľa mŕtvych shinobi, vrátane Kageho, a počas tejto vojny zahynulo nespočetné množstvo ľudí. Naruto Uzumaki, Sasuke Uchiha, Sakura Haruno a Kakashi Hatake boli hlavnou silou na strane Aliancie Shinobi a oni boli tí, ktorí zosadili Obita Uchihu. Bojujú dokonca s Madarou Uchihou. Ku koncu štvrtej veľkej nindžskej vojny sa Kaguya Otsutsuki vrátil a bol zapečatený v inej dimenzii mocou Šiestich ciest: Chibaku Tensei. Naruto Uzumaki a Sasuke Uchiha bojovali medzi sebou kvôli stretu ideálov.
Sasuke však nakoniec prehral a rozhodol sa nasledovať Narutovu cestu vpred. Nekonečné Tsukuyomi skončilo a do sveta sa konečne vrátil mier, ktorý zostáva relatívne v pokračovaní, Boruto: Naruto Next Generations, s Karou a potomkami Otsusuki sa opäť pokúsili prebudiť Kaguya. To dokazuje, že napriek všetkému, čo Naruto a predchádzajúca generácia urobili, zmenšili zlo vo svete shinobi, ale nepriatelia stále číhajú v tieni - aj keď nie sú takí mocní.